在日外国人の確定申告：期限を逃すと在留資格に影響 | MyKyoten

最終確認：2026年。 本ガイドは、出入国在留管理局の規則、厚生労働省のガイドライン、および日本の標準的な行政実務に基づいています。情報提供を目的としたものであり、法的アドバイスを構成するものではありません。個別の状況については、入管専門の弁護士または公的機関にご相談ください。

税務署から「申告が必要です」という通知が届くことはありません。しかし、申告義務があったにもかかわらず申告していなかったことが判明した場合、利子付きのペナルティ通知が確実に届きます。在日外国人にとって、これは仮定の話ではありません。実際によく起こることであり、その影響は銀行口座だけでなく、在留資格にまで及びます。

本ガイドでは、申告が必要な人、申告を誤った場合のコスト、そして実際の申告方法について詳しく説明します。

日本で働くほとんどの給与所得者は、確定申告を行いません。勤務先が12月に年末調整を行い、それで手続きが完結するからです。しかし、この仕組みが機能しないケースが4つあります。

ケース1：2か所以上の勤務先からの収入がある場合 同一の課税年度に2社から給与を受け取っていた場合、メインの勤務先の年末調整では2か所目の収入はカバーされません。合算した収入を申告する必要があります。たとえば、年の途中で転職し、前の職場から最終給与を受け取りながら新しい職場での勤務を開始したケースがこれに該当します。

ケース2：副収入が¥200,000を超える場合 フリーランスの仕事、オンライン個人指導、コンテンツ制作、海外不動産からの賃貸収入など、メインの雇用以外の収入の合計が暦年で¥200,000を超える場合、申告が法律上義務付けられています。¥200,000の基準は総収入ではなく純収入ですが、それを証明するには経費の記録が必要です。

ケース3：海外からの収入がある場合 経営・管理ビザを持つブラジル人ITコントラクターが、サンパウロのクライアントからコンサルティング報酬を受け取っている場合でも、居住者納税者に該当すれば、その収入に対して日本の所得税が課されます。これは多くの人が見落とすポイントです。「海外の収入には日本の税金はかからない」という思い込みは、居住要件を満たした時点で誤りとなります。

ケース4：勤務先が年末調整を完了していない場合 これは実際によくあることです。小規模な会社が12月の期限に間に合わないことがあります。年の途中で廃業または事業再編を行った雇用主が、正しい源泉徴収票を発行しないこともあります。理由のいかんにかかわらず年末調整が完了していない場合、申告義務は本人に直接かかってきます。

現実のチェック： 在日外国人からの報告によると、小規模な居酒屋チェーン、英会話学校、アルバイト先の雇用主は、源泉徴収票の発行が遅れたり、不完全な書類を発行したりするケースが頻繁にあります。2月になってから書類を催促するのでは、すでに時間的に余裕がありません。1月中に動いてください。

→ Document Decoderを使って、日本語の行政書類を翻訳・解読しましょう。

日本の税制は、ビザの種類ではなく、居住状況に基づいて明確な線引きをしています。

183日ルール： 暦年内に183日を超えて日本に居住している場合、税務上は一般的に居住者として扱われます。居住者は世界中の所得に対して日本の所得税を納める義務があります。非居住者は、日本を源泉とする所得のみが課税対象です。

注意が必要なのは、ビザの種類と税務上の居住者区分は別の分類だという点です。配偶者ビザを持つ人が年の大半を海外で過ごしていた場合、有効な在留資格を持ちながらも税務上は非居住者に該当することがあります。逆に、就労ビザで年の初めに来日し12月まで滞在した短期就労者は、永住を意図していなくても、フルの居住者納税者となります。

よく誤って区分されるケース： 一般的な経験から、日本と母国を行き来する特定技能ビザ保持者、および海外からの就労収入がある日本人配偶者を帯同する配偶者などが挙げられます。

ご自身の収入状況とビザの種類が予期しない義務を生じさせているかどうか確信が持てない場合、Immigration Risk Checkerを使って、詳しく確認が必要な点を洗い出すことができます。

この期間は毎年固定されています。申告受付は2月16日に始まり、3月15日の業務終了時に締め切られます。納付が必要な税金も3月15日までに納めなければ、その翌日から利子が発生します。

申告場所 申告は、ご自身の住民登録住所を管轄する税務署で行います。市役所でも区役所でもありません。税務署です。郵便番号から担当の税務署を国税庁のウェブサイトで検索できます。

3月15日より前に日本を離れる場合 出国前に納税管理人を選任する必要があります。通常は税理士、あるいは場合によっては税務署に届け出た信頼できる個人が担当します。納税管理人を置かなくても申告義務はなくなりません。ペナルティが不在中も積み重なり続けます。

e-Tax 国税庁のe-Taxシステムを使えば、税務署に足を運ばずにオンラインで申告できます。マイナンバーカードと対応したICカードリーダーが必要です。あるいは、近年導入されたスマートフォンを使った本人確認方法も利用できます。一般的な経験から言うと、インターフェースは日本語のみで、ICカード認証の設定手順は初めて申告する人が戸惑うことが多いです。正しく設定するために、ある程度まとまった時間を確保してください。

ステップバイステップチェックリスト：e-Taxで申告する

• マイナンバーカードが有効で、PINがロックされていないことを確認する
• 国税庁の確定申告書作成ソフトをダウンロードするか、ブラウザベースのツールを使用する
• 作成を始める前にすべての源泉徴収票を手元に揃える（特定の数値が必要です）
• 収入源ごとに収入を別々に入力する
• 控除を追加する：国民健康保険料、年金の支払い額、生命保険料控除証明書
• 送信前に計算された税額を確認する
• 送信し、受付番号を保存する
• 残額がある場合は3月15日までに銀行振込またはコンビニ払込票で納付する

これらの書類が手元に揃ってから申告作業を始めてください。書類が揃っていない状態で始めると途中で手が止まり、途中まで記入した申告書は、期限を過ぎた申告書より多くの問題を引き起こすことがあります。

すべての勤務先からの源泉徴収票 源泉徴収票は、年間給与額とすでに控除された税額が記載された書類です。課税年度中に給与を支払ったすべての雇用主が発行する義務を負います。前の勤務先からまだ届いていない場合は、1月中に人事部または経理部に書面で連絡してください。連絡が取れない場合や廃業している場合は、管轄の労働基準監督署に照会してください。書類がどうしても入手できない場合は、銀行の記録を使って収入を推計するNTAのオンラインシステムを利用できますが、追加の書類が必要です。

源泉徴収票をお持ちで、各項目の読み方がわからない場合は、Gensen Withholding Slip Decoderですべての項目をわかりやすい英語に翻訳できます。

海外収入の証明書類 海外の雇用主からの銀行明細、給与明細、契約書、または公式の収入証明書類。取得額と通貨が明記されている必要があります。当該年度の日本銀行が公表するTTM（電信売買相場の仲値）を使って円に換算します。

国民健康保険料の支払い記録 年間を通じて支払った国民健康保険料は控除の対象となります。領収書を紛失した場合は、市区町村役場で支払証明書を発行してもらえます。申請する価値があります。中程度の給与では、国民健康保険料控除によって課税所得を意味のある金額だけ減らせます。控除の対象となるものについては、健康保険ガイドをご覧ください。

年金の支払い記録 国民年金に加入している場合、年間の支払額は全額控除の対象となります。日本年金機構は毎年10月から11月にかけて社会保険料控除証明書を郵送します。捨てないでください。

来日した当初は誰も教えてくれないことがあります。申告しないことへのペナルティは軽くなく、しかも入管記録と直接連動しています。

無申告加算税： 申告義務があったにもかかわらず申告しなかったと国税庁が認定した場合、未納税額に対して15%の加算税が課されます。未納税額が¥500,000を超える場合、その超過分には20%が課されます。

延滞税： 加算税に加えて、本来の期限の翌日から毎日延滞税が発生します。税率は国税庁が毎年設定します。最初の2か月間は低い税率が適用され、その後引き上げられます。¥300,000の未払い残高が12か月続いた場合、利子と加算税の合計はかなりの金額になります。

具体例：指導員ビザを持つカナダ人英語教師が、主な学校法人から¥3,200,000、プライベートな個人指導の副業から¥280,000を受け取っています。¥280,000は¥200,000の基準を超えています。この教師は申告しませんでした。2年後、国税庁がマイナンバーの記録と支払いデータを照合します。この教師は¥280,000分の追徴税に加え、未納額に対する15%の加算税、さらに約2年分の日割り延滞税を負うことになります。ペナルティの合計は、当初の税額を¥100,000以上超えることもあります。

在留カードとの関係 ここで多くの人が深刻なミスを犯します。未納税は市区町村の税務記録に残り、ビザ更新や永住許可申請の審査時に確認されます。一般的な経験や出入国在留管理局の文書によると、未納税はPR審査でフラグが立てられ、在留資格の更新を遅らせたり、複雑にしたりする可能性があります。既存のコンプライアンス上の問題が申請に影響する可能性があるかどうかは、PR Risk Checkerで確認できます。

永住申請を検討されている方は、Japan PR 2026 ガイドに、税務コンプライアンスの履歴が審査にどのように影響するかが詳しく説明されています。

警告： 正直なところ、在留カード更新時の指摘が最も驚かれる結果です。罰金は覚悟していても、入管の審査官から「3年前の未払い住民税がある理由を説明してください」と聞かれることは想定していないでしょう。実際に聞かれます。記録はついてまわります。

昨年申告すべきだったと気づいた場合は？ すぐに期限後申告を行ってください。国税庁から連絡が来る前に自主的に申告すれば、ペナルティは低くなります。税務調査が始まる前に申告すれば15%の加算税が適用されます。連絡が来てから申告した場合は、さらに追加のペナルティが重なります。

1か所の雇用主からの収入のみで年末調整がすべてカバーしていると思っていたが、実はそうではなかった場合は？ まず勤務先の人事部に連絡してください。年末調整が完了したかどうかを書面で確認してください。完了していない場合、ご自身で独立して申告する義務があります。雇用主が年末調整を完了しなかった責任がペナルティという意味で本人に移転するわけではありませんが、申告義務はあくまでご本人にあります。

次のステップ：今課税年度に給与を支払ったすべての勤務先から源泉徴収票を入手し、勤務先が年末調整を完了したかどうかを確認し、上記の4つの申告要件のいずれかが自分に当てはまるかどうかを確認してください。これを1月末までに行ってください。申告受付が始まる2月16日まで待つと、書類の問題の解決と申告期限の対応が重なってしまいます。

アルバイトのみで¥1,030,000以下しか稼いでいない場合も申告が必要ですか？ 必ずしもそうではありません。雇用主が1か所のみで年末調整が完了している場合は、一般的にカバーされます。ただし、複数のアルバイト先があり、いずれの雇用主もあなたの代わりに調整を行っていない場合は、合算収入を確認する必要があります。¥200,000の副収入基準は、メインの雇用以外の収入源ごとに適用されます。

税務署で英語で申告できますか？ 都市部の大きな税務署では、申告シーズン中の特定の日に多言語対応スタッフや通訳サービスを設けているところもあります。一般的な経験から言うと、これは場所によって大きく異なり、保証されているわけではありません。日本語を話せる友人を連れて行くか、外国人客を対応する税理士を雇う方が確実です。

給与から税金が引かれていたとしても、追加で納税が必要ですか？ 可能性があります。給与からの控除は、その雇用主からの給与のみを基準とした見積もりです。他の収入源がある場合、源泉徴収された税額が実際の納税額に届いていないことがあります。確定申告の手続きで実際の税額を計算し、還付か追加納付かが決まります。

給与明細や源泉徴収票の数字が読み取れず困っている場合は、Payslip Decoderが日本語の給与項目を平易な英語に置き換え、確定申告にそのまま使える控除欄の意味も解説します。税理士の代わりにはなりませんが、漢字を読み違えて誤った数字を入力してしまうミスを防げます。